Prima di tutto, credo che linux non sia un sistema più sicuro, ma che il minor numero di malware a cui è vulnerabile dipenda dal fatto che gli altri SO sono più comuni. Inoltre, di norma, gli utenti linux sono più "esperti": essendo in grado di installare un sistema operativo (mio padre non ne sarebbe mai in grado, ad esempio) sono probabilmente più abili dell'utente medio, risultando più cauti nell'esplorazione della rete. inoltre, il "multi-user environment" (cito dall'articolo) che protegge linux non gli è unico: si possono ottenere risultati analoghi utilizzando un account con privilegi limitati su Windows.
Concludo citando un articolo riguardante la sicurezza tanto pubblicizzata da Apple: